Kirkon hallintoa sääntelevät kirkkolaki, kirkkojärjestys ja kirkon vaalijärjestys. Lisäksi tulevat piispainkokouksen ja kirkkohallituksen määräykset. Nämä säädökset julkaistaan Suomen säädöskokoelmassa.
Seurakunnan tasolla käytännön toimintaa ohjaavat kirkkovaltuuston ja kirkkoneuvoston ohjesäännöt, jotka pohjautuvat valtakunnallisiin säädöksiin. Paikallistason ohjesäännöillä ohjataan toimintaa yleensä yksityiskohtaisemmin.